相信讀了上文（衰老與腫瘤研究利器：全新升級的GeoMx Digital Spatial Profiler數字空間組學檢測平臺）之后您已經對GeoMx Digital Spatial Profiler數字空間分析儀有了一定的了解，讓我們接下來繼續了解一下DSP的應用吧~

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GeoMx DSP應用領域

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產品分類-RNA檢測

GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas

GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas（Hu WTA）空間全轉錄組技術實現了人類組織原位全轉錄組表達分析。其通過獨特的探針結構設計，大大提高了對每個轉錄本的檢測靈敏度和可信度。Hu WTA基于Human Gene Nomenclature Committee（HUGO）數據庫，同時參照National Center for Biotechnology’s Information（NCBI）RefSeq數據庫中的mRNA序列，可檢測超過18000種人類蛋白編碼基因。DSP RNA探針在保證靶標分子高特異性的基礎上，還針對多種因素進行了篩選優化，保證每個探針都對應一個獨特的DSP條形碼?？捎糜谙掠卧趇llumina測序儀上進行分子計數。Hu WTA采用靶向捕獲的技術原理，避免了基于poly（A）的技術局限性，從而實現了對于嚴重降解的組織（如FFPE）也有高靈敏度的穩定表現。它能夠對于每個目標區域（ROI）內的全轉錄組進行測量，幫助研究者高分辨率地探索組織微環境和細胞群之間的差異，以及背后詳細的生物通路。

產品亮點：

涵蓋人類全部蛋白編碼基因mRNA序列的特異性探針；

出色的檢測靈敏度：能夠在小于50um的區域內檢測出數千個基因；

對于包括FFPE在內的各種樣本類型均具有可靠性能，分析結果與RNA-seq和RNAScope技術驗證數據高度一致；

聯合單細胞轉錄組測序（scRNA-Seq）數據，可在組織原位研究不同細胞亞群；

流暢整合了illumina測序文庫制備流程和簡化的NGS數據分析方案；

出眾的靈活性，用戶可定制添加至多60個額外靶點，如非編碼RNA、合成DNA序列或者外源基因（如細菌、病毒）等；

利用GeoMx Data Suite和生物信息學工具進行空間轉錄組統計分析。

GeoMx Mouse Whole Transcriptome Atlas

小鼠模型在了解發育生物學、疾病發作、進展和治療方面發揮著關鍵作用。然而在小鼠轉錄組研究中，組織異質性會增加細胞群或單細胞RNA-seq數據結果的復雜性。使用GeoMx小鼠全轉錄組分析（MuWTA），研究人員可以應用空間轉錄組學來揭示小鼠模型中的組織結構和基礎功能。

產品亮點：

全轉錄組覆蓋度，覆蓋所有小鼠品系；

出色的靈敏度，每份樣本可檢測的基因數更多，可定量低、中和高表達基因；

穩定可靠、可重復的結果，適用于多種樣本類型。包括FFPE、新鮮冷凍、固定冷凍和TMA樣本；

高效實現多樣本數據的比較，識別與生物學密切相關的特定區域或細胞群的表達變化；

標準化工作流程，運用成熟技術，無需額外驗證與優化；

GeoMx Cancer Transcriptome Atlas

Cancer Transcriptome Atlas（CTA）支持以空間分辨率同時分析超過1,800個RNA靶標，包含細胞分析普遍應用的靶標，以及GeoMxDSP實驗的必要對照。CTA覆蓋112條對免疫應答、腫瘤生物學和微環境至關重要的通路。GeoMxCancer Transcriptome Atlas（CTA）支持全面地分析腫瘤、腫瘤微環境和腫瘤免疫狀態。

產品亮點：

全面的RNA檢測靶點，用于癌癥生物學研究；

廣泛覆蓋免疫應答、腫瘤微環境和腫瘤生物學研究；

包含來自臨床相關基因集，例如腫瘤炎性BC360IIO360 指數和PAM50；

超過100條通路，全方位探索癌癥；

兼容RNAscope和抗體形態學標志物；

支持增添多達60個額外的目標靶標；

流暢整合illumina高通量測序技術；

利用GeoMx Data Center進行交互式分析。

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產品分類-蛋白檢測

GeoMx Human Protein Assays

GeoMx Human Protein Assays 結合NGS 技術流程能夠以空間分辨率同時分析數百種蛋白質靶標的表達。包含4種蛋白的GeoMx Protein Core for NGS包含GeoMx DSP實驗所需的對照品。GeoMx Human Protein Assays具有模塊化設計，提供經驗證的檢測靶標，用于免疫學、腫瘤免疫學和神經科學研究。

產品亮點：

經驗證的多靶標檢測，專為免疫學、腫瘤免疫學和神經科學等研究設計；

在10種檢測模塊中選擇并添加到GeoMx Human Protein Core，可實現對數百種蛋白質 靶標的空間表達定量；

可另外定制多達10個目標抗體；

流暢整合illumina高通量檢測技術；

利用 GeoMx Data Center進行交互式分析。
責任編輯：彭菁