PCR因其出色的靈敏度、耐受核苷酸變異的能力以及執(zhí)行多重檢測的能力而被廣泛認為是核酸檢測(Nucleic acid testing,NAAT)的金標準。超快速PCR系統(tǒng)的開發(fā)需要使用精密的儀器。為了促進即時檢測(POCT)應(yīng)用的快速PCR,微流控技術(shù)因其在試劑分配、減少反應(yīng)體積、自動化的方面的優(yōu)勢而得到了廣泛的研究。其中,基于介電潤濕(Electrowetting-on-dielectric,EWOD)的數(shù)字微流控(Digitalmicrofluidics,DMF)可實現(xiàn)單個液滴精準操控,其高度可配置化有望實現(xiàn)在芯片實驗室應(yīng)用中開發(fā)高效的工作流程。然而,基于EWOD的數(shù)字微流控系統(tǒng)在實現(xiàn)PCR熱循環(huán)中在高溫下容易形成氣泡。
此外,液滴在熱區(qū)之間的快速和頻繁移動會導(dǎo)致介電質(zhì)擊穿(dielectric breakdown),在超快速的熱循環(huán)反應(yīng)中溫度傳感器對液滴溫度傳感的不準確,這些都可能損害EWOD PCR的耐用性。這些技術(shù)挑戰(zhàn)阻礙了EWOD應(yīng)用于現(xiàn)場診斷的即時快速PCR。
近期,澳門大學(xué)賈艷偉教授課題組報道了一種基于介電潤濕數(shù)字微流控平臺的超快速PCR,采用雙層加熱、多孔超疏水膜、隔溫槽、可溶性化學(xué)溫度傳感器等技術(shù),綜合解決了介電潤濕數(shù)字微流控系統(tǒng)進行PCR熱循環(huán)的穩(wěn)定性問題,使得PCR在3.7 ~ 5分鐘內(nèi)完成40個熱循環(huán),并與傳統(tǒng)PCR靈敏度相當(dāng)。相關(guān)成果以“Sub-5-Minute Ultrafast PCR using Digital Microfluidics”為題發(fā)表在國際學(xué)術(shù)雜志Biosensors and Bioelectronics上。
具體而言,在該研究中,研究團隊開發(fā)了一個集成的EWOD數(shù)字微流控PCR系統(tǒng),該系統(tǒng)解決了基于EWOD平臺上快速PCR的穩(wěn)定性問題。系統(tǒng)原理及結(jié)構(gòu)圖如圖1(a)所示。該EWOD PCR系統(tǒng)采用介電潤濕介導(dǎo)的液滴在不同溫區(qū)之間以移動的方式來完成PCR熱循環(huán)。
由于液滴在不斷快速移動中完成PCR熱循環(huán),常規(guī)溫度傳感器不適用于檢測移動液滴中的溫度,另外,傳感器與液滴實際溫度之間的溫度偏差容易導(dǎo)致芯片上PCR效率降低。因此,研究團隊采用一種可溶性溫度傳感器(磺酰羅丹明B)來進行精確的液滴內(nèi)溫度校準和調(diào)控,以實現(xiàn)高效的芯片上EWOD PCR。高溫變性溫區(qū)采用頂部和底部雙層加熱方式,減少了液滴的垂直溫度差,以確保液滴PCR的穩(wěn)定性和準確性。
為了有效地消除高溫引起的介電擊穿和氣泡的產(chǎn)生,研究團隊采用聚二甲基硅氧烷(PDMS)作為介電層來保護電極在高溫下不被擊穿。多孔膨體PTFE(expanded PTFE,ePTFE)覆蓋在半固化的PDMS上作為疏水層,由于其多孔的可膨化特性,不容易因高溫下的熱膨脹而破裂,從而消除了因表面疏水層損傷而產(chǎn)生的氣泡。
為了加快液滴PCR的反應(yīng)速度,在頂部高溫薄膜加熱器的周圍設(shè)置了隔熱槽(Thermal isolation groove,TIG)(見圖1(b)),使得變性和退火/延伸兩個溫度區(qū)的水平溫度差增大,顯著減少了兩區(qū)之間的PCR液滴穿梭移動距離。最后,一種新型的移動電極聯(lián)鎖排列(Interlockingconfiguration)降低了移動電極對液滴大小的限制,使得大于0.2 μL大小的液滴可以在大于30°C的溫度差下連續(xù)移動,不受熱毛細管效應(yīng)的影響阻礙液滴向高溫區(qū)移動。
圖1 基于介電潤濕數(shù)字微流控的超快速PCR系統(tǒng)原理圖
以上技術(shù)確保了PCR液滴在準確控溫的不同溫區(qū)穩(wěn)定移動以進行熱循環(huán),使得所開發(fā)的集成EWOD數(shù)字微流控系統(tǒng)在3.7 min內(nèi)實現(xiàn)了40個循環(huán)的超快PCR。此外,對一種可逆的熱啟動試劑的應(yīng)用(ThermaStopTM)消除了芯片上PCR的非特異擴增。連續(xù)梯度稀釋實驗(Serial dilutions)驗證了EWOD超快速PCR靈敏度與傳統(tǒng)PCR一致,其效率達到95.31%。
圖2 基于數(shù)字微流控的芯片上PCR
綜上所述,該研究介紹了一種基于EWOD數(shù)字微流控的穩(wěn)健的超快速PCR系統(tǒng)。該研究采用的新材料及技術(shù)的組合有效增強了EWOD芯片的耐用性,可在超過30°C的溫度梯度上至少實現(xiàn)240個液滴穿梭。體積為0.6 μL 的超快EWOD PCR在3.7 ~ 5.0分鐘可實現(xiàn)40個熱循環(huán)。比傳統(tǒng)的PCR方法加速10 ~ 17倍。此EWOD系統(tǒng)還為NAAT用于檢測傳染性病原體、耐藥性分子檢測、法醫(yī)學(xué)和其他基于PCR的實際應(yīng)用提供了可能性。
審核編輯:劉清
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原文標題:用于即時檢測的超快速數(shù)字微流控PCR
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