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研究人員基于NVIDIA GPU創建了可預測的3D細胞模型

NVIDIA英偉達企業解決方案 ? 來源:未知 ? 作者:胡薇 ? 2018-07-10 11:21 ? 次閱讀

艾倫細胞科學研究所(Allen Institute for Cell Science)由微軟聯合創始人Paul Allen在西雅圖成立,其研究人員創建了第一個針對人類活細胞的可預測3D模型。借助此模型,科學家可以在計算機屏幕上以數字化的方式呈現、甚至控制細胞行為。

“這是迄今為止科學界中最令我驚嘆的事情,”艾倫細胞科學研究所常務董事Rick Horwitz說道。“現在,我們可以三維形式在影片中動態觀察細胞的內部工作原理。”

為創建此模型,研究人員使用了NVIDIA GPU、NVIDIA DGX StationAI超級計算機和cuDNN加速PyTorch深度學習框架,使用識別原子核等細胞結構的蛋白質標簽來研究圖像。

點擊以下視頻了解此3D模型及研究人員的講解。

超越緩慢且昂貴的傳統工具

目前,科學家已經使用熒光顯微鏡(使用熒光研究物體的顯微鏡)觀察了細胞的內部結構,這個過程成本高昂、緩慢且具有破壞性。顯微鏡的成本可達數萬美元,所有蛋白質都需要特別的標注,并且熒光會破壞細胞內的DNA。

在新的模型中,研究人員使用卷積神經網絡重建3D透射光和熒光細胞圖像在大的細胞結構方面的關系。這將教會模型使用不同蛋白質和細胞器(細胞體中的微器官)的“自助”樣本構建自己的3D結構。

“這是觀察人類活細胞內部結構的全新方法,”Rick Horwitz表示。“就像第一次看到整個細胞一樣。在未來,這將影響藥物發現、疾病研究以及我們進行人體細胞基礎研究的方式。”

艾倫集成細胞模型甚至可以預測有絲分裂(或細胞分裂)事件的動態。例如核膜和細胞膜重組。在此之前,我們幾乎不可能預測此類圖像,尤其是3D圖像。

利用諸如此類的功能,對于癌癥研究、制藥以及生物技術等領域,該模型將有可能徹底改變未來的細胞研究。

聲明:本文內容及配圖由入駐作者撰寫或者入駐合作網站授權轉載。文章觀點僅代表作者本人,不代表電子發燒友網立場。文章及其配圖僅供工程師學習之用,如有內容侵權或者其他違規問題,請聯系本站處理。 舉報投訴
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原文標題:AI賦能細胞3D建模,以全新方式探索細胞里的微觀世界

文章出處:【微信號:NVIDIA-Enterprise,微信公眾號:NVIDIA英偉達企業解決方案】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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