資料介紹
近年來,RNAseq技術(shù)被廣泛應(yīng)用于差異表達基因和異構(gòu)體的檢測,但目前大多數(shù)方法都是識別單個異構(gòu)體的差異表達,無法同時檢測同一個基因中所包含異構(gòu)體表達比例的差異,因此提出一個差異異構(gòu)體比例檢測方法。該方法基于先前設(shè)計的sl。DASeq模型,運用該模型中隱含變量的概率分布,采用KI。散度進行差異異構(gòu)體比例的分析。首先使用最新的SEQC數(shù)據(jù)集評估sLDASeq模型表達水平的性能,結(jié)果表明該方法能準確地估計基因中異構(gòu)體的比例。接著通過模擬數(shù)據(jù)集進行差異異構(gòu)體比例的檢測,與其他方法相比,實驗結(jié)果表明該方法在差異異構(gòu)體比例檢測方面具有較高的準確性。
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